Надання Куяльницькому лиману природоохоронного статусу зайняло багатьох років та відбулось завдяки зусиллям науковців, науково-освітніх установ та громадських організацій. Створенню заповідної території передувала велика кількість наукових досліджень, які стосувались біорізноманіття, ландшафтних особливостей, гідрологічного режиму тощо.
Надання Куяльницькому лиману природоохоронного статусу зайняло багатьох років та відбулось завдяки зусиллям науковців, науково-освітніх установ та громадських організацій. Створенню заповідної території передувала велика кількість наукових досліджень, які стосувались біорізноманіття, ландшафтних особливостей, гідрологічного режиму тощо.
Робота з включення природних комплексів Куяльницького лиману до природно-заповідного фонду України була розпочата Державним управлінням охорони навколишнього природного середовища в Одеській області у 2009 році. В рамках проекту «Комплексне використання земель євразійських степів» Українським товариством охорони птахів за участю спеціалістів Одеського національного університету імені І.І. Мечникова було розроблено наукове обґрунтування щодо створення національного природного парку «Куяльницький». У рамках міжнародного проекту «Посилені економічні та правові інструменти для збереження степового біорізноманіття, адаптація до змін клімату та їх пом’якшення (Степове біорізноманіття)» (DCI-ENV/2010/221-005) у 2011–2013 роках наукове обґрунтування щодо створення Парку було доопрацьоване.
З питань створення національного природного парку «Куяльницький» та узгодження його меж з 2011 року проводилась значна кількість нарад при Одеській обласній державній адміністрації, районних державних адміністраціях Одеської області.
Питання розглядалось на сесіях сільських рад, засіданні постійної комісії з питань екології, природокористування надзвичайних ситуацій і ліквідації їх наслідків Одеської обласної ради, проводились відповідні обговорення з землекористувачами та користувачами природних ресурсів, за результатами яких коригувалась площа майбутнього Парку.
У 2018 році Куяльницький лиман набув статусу курорту державного значення відповідно до Закону України «Про оголошення природних територій Куяльницького лиману Одеської області курортом державного значення». Регіональна влада клопотала про це ще у 2014-му році, відзначаючи «особливо цінні, унікальні природні лікувальні ресурси» водойми — ропу (вода з високим ступенем мінералізації) та пелоїди (лікувальні грязі). Ці ресурси використовують для лікування захворювань нервової та травної систем, опорно-рухового апарату тощо.
У березні 2021 року уряд погодив створення національного природного парку «Куяльницький» і 1 січня 2022 року указом президента України Парк був створений на території Березівського та Одеського районів Одеської області. Метою створення Парку є збереження, відтворення та ефективне використання природних комплексів та об’єктів у басейні Куяльницького лиману, які мають особливу природоохоронну, оздоровчу, історико-культурну, наукову, освітню, естетичну цінність. До території національного природного парку «Куяльницький» включено 10800,8867 гектара земель державної та комунальної власності, а саме: 3490,6753 гектара, що надаються національному природному парку в постійне користування, та 7310,2114 гектара, що включаються до його території без вилучення у землекористувачів.